Hace aproximadamente 6.000 años, mucho antes del surgimiento de la cultura muisca y de las primeras sociedades agrícolas complejas del Altiplano Cundiboyacense, una población de antiguos cazadores-recolectores habitaba las tierras altas de lo que hoy conocemos como Bogotá. Sin embargo, su historia genética escondía un misterio que la ciencia apenas comienza a revelar: aquellos habitantes pertenecían a un linaje humano hasta ahora desconocido.
Un extraordinario estudio publicado en mayo de 2025 en la revista científica Science Advances reconstruyó casi 6.000 años de historia demográfica de Colombia mediante el análisis del ADN antiguo de 21 individuos prehispánicos. Los resultados revelaron que los primeros habitantes analizados del Altiplano de Bogotá tenían una ascendencia genética profundamente diferenciada de otras poblaciones antiguas y actuales de América.
Un linaje que no había sido identificado
La investigación, liderada por Kim-Louise Krettek, Andrea Casas-Vargas y Cosimo Posth, examinó restos humanos procedentes de cinco sitios arqueológicos del Altiplano Cundiboyacense, entre ellos Checua, Laguna de la Herrera, Las Delicias y Soacha.
Uno de los hallazgos más sorprendentes surgió del análisis de siete individuos procedentes del sitio arqueológico de Checua, cuyos restos fueron fechados aproximadamente hace 6.000 años.
Los investigadores descubrieron que esta población pertenecía a un linaje basal previamente desconocido, derivado de las primeras ramificaciones de la diversidad genética que surgió durante el poblamiento de América del Sur.
En otras palabras, aunque compartía una historia evolutiva profunda con otros pueblos indígenas americanos, su composición genética no mostraba una afinidad particular con ninguno de los grupos antiguos o actuales de América Central y del Sur incluidos en el estudio.
Además, este linaje no presentaba la ascendencia característica de los antiguos individuos asociados con Anzick-1, en Norteamérica, ni de las poblaciones antiguas de las islas del canal de California.
Pero existe un detalle todavía más extraordinario: los investigadores no encontraron evidencia de que aquella población hubiera contribuido genéticamente a las poblaciones sudamericanas posteriores analizadas. Su historia genética parece representar una rama ancestral que no dejó una continuidad detectable en los grupos estudiados.

Una transformación demográfica que cambió la historia del Altiplano
El estudio también reveló que, entre hace 6.000 y 2.000 años, ocurrió una transformación genética de enorme magnitud en el Altiplano.
Los análisis indican que la ascendencia de aquellos antiguos cazadores-recolectores fue reemplazada por otra población relacionada genéticamente con grupos de América Central, particularmente con poblaciones vinculadas a los pueblos de habla chibcha del istmo de Panamá.
Esta transformación coincide temporalmente con la expansión del complejo cerámico Herrera, una tradición arqueológica que se desarrolló en el Altiplano y que estuvo asociada con importantes cambios culturales y demográficos.
Los resultados respaldan la hipótesis de que la introducción de determinadas tradiciones cerámicas estuvo acompañada por movimientos de población, aunque los investigadores advierten que todavía no es posible establecer con exactitud cuándo ocurrió este proceso ni cuáles fueron todos sus mecanismos.
Posteriormente, la nueva composición genética permaneció relativamente estable durante más de 1.500 años, atravesando diferentes transformaciones culturales y llegando hasta el período muisca.
Una historia mucho más antigua y compleja de lo que imaginábamos
Este descubrimiento representa un avance fundamental para comprender el pasado de Colombia. Durante mucho tiempo, las investigaciones arqueológicas permitieron reconstruir las transformaciones culturales de las antiguas sociedades del territorio. Ahora, el análisis del ADN antiguo está revelando que esos cambios también estuvieron acompañados por profundas transformaciones en la historia de las poblaciones humanas.
El Altiplano de Bogotá fue escenario de encuentros, desplazamientos y reemplazos demográficos que ocurrieron miles de años antes de la llegada de los europeos.
Y quizá lo más fascinante es que todavía existen capítulos desconocidos de esta historia. Los propios investigadores señalan que será necesario analizar más restos humanos antiguos de Colombia y regiones vecinas para comprender mejor el origen, la expansión y las relaciones entre estos linajes ancestrales.
Hace 6.000 años, una población con una historia genética hasta ahora desconocida caminaba por las tierras altas de Colombia. Hoy, gracias a la ciencia, podemos comenzar a reconstruir su existencia y comprender que el pasado humano de nuestro territorio es mucho más diverso, antiguo y sorprendente de lo que imaginábamos.
Referencia científica
Krettek, K. L. et al. (2025). A 6000-year-long genomic transect from the Bogotá Altiplano reveals multiple genetic shifts in the demographic history of Colombia. Science Advances, 11, eads6284.
Publicado el 28 de mayo de 2025.