El estudio de la ecología en gran manera requiere de una amplia comprensión, por esta causa podemos encontrar dentro de esta unos niveles de organización. Para los ecólogos modernos (Begon, Harper y Townsend, 1999)(Molles, 2006), la ecología puede ser estudiada a varios niveles o escalas:
Los organismo (las interacciones de un ser vivo dado con las condiciones abióticas directas que lo rodean), tales como:
La población (las interacciones de un ser vivo dado con los seres de su misma especie)
Las comunidades (las interacciones de una población dada con las poblaciones de especies que la rodean),
El ecosistema (las interacciones propias de la biocenosis sumada a todos los flujos de materia y energía que tienen lugar en ella)
Y la biosfera (el conjunto de todos los seres vivos conocidos).
